DNA(液体荧光型)恒温快速扩增试剂盒

DNA(液体荧光型)恒温快速扩增试剂盒                                                  (货号:WLE5003

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原理概述:

本试剂盒基于一种常温恒温核酸快速扩增技术:在常温恒温下,重组酶和引物形成蛋白/单链核苷酸的复合体Rec/ssDNA,在辅助蛋白和单链结合蛋白SSB的帮助下,侵入双链DNA模板;在侵入位点形成D-loop区域,并开始对DNA双链进行扫描;待找到与引物互补的目的区域后,复合体Rec/ssDNA解体的同时,聚合酶也结合到引物的3’末端,开始链的延伸。本试剂盒在39 ºC下,依赖核酸外切酶的作用,加入根据模版设计的特异的分子探针,使用荧光监测设备能实现对目标片段扩增过程的实时监控。

引物设计:

建议使用长度在30-35 bp的引物,引物过短会影响扩增速度和检测灵敏度;引物设计避免形成二级结构而影响扩增;扩增子长度建议在150-300 bp,通常不超过500 bp。

荧光探针设计:

探针序列不与特异性引物识别位点重叠,长度为46-52 nt,序列避免回文序列、内部二级结构和连续的重复碱基。探针共有四个修饰位点:距离5’端的≥35 nt的中部位置标记一个dSpacer(四氢呋喃,THF),作为核酸外切酶的识别位点;THF位点的上游标记一个荧光基团,下游标记一个粹灭基团,两个基团的间距为2-4 nt;THF距离3’末端≥15 nt,并且3’末端标记一个修饰基团,例如胺基、磷酸基团或C3-Spacer。

试剂盒组成:

   100T/盒

组成 含量
C buffer 1 mL×2管
L buffer 500 μL×1管
P-core 1.2 mL×1管
E-core 60 μL×1管
B buffer 300 μL×1管
使用说明书 1份

试剂盒储存:

运输条件:低温运输;

储存条件:储存温度 ≤ -20 ºC,避光保存,避免重压、反复冻融;

 

操作步骤:提前将试剂盒所需组分取出,冰上或低温下融化(C buffer可室温融化),震荡混匀

1) 向无菌0.2mL PCR管中加入20 μL C buffer、5 μL L buffer;

2) 加入2 μL上游引物、2 μL下游引物和0.6 μL探针,再加入1.5μL dNTPs(10 mM);

3) 向反应管中加入12 μL P-core和0.6 μL E-core,(步骤1~3可以混合后再分装至反应管中);

4) 向反应管中加入3.8 μL核酸模板;

5) 最后向反应管中加入2.5 μL B buffer并充分混合(加入B buffer反应立即被启动);混匀后,将反应液甩(或快速离心)至管子底部,然后立即将反应管放入荧光检测设备中。荧光检测程序设置为:恒温39 ºC;每30 s采集一次荧光信号;反应时间20 mins。

注:如使用ABI系列PCR仪,请务必于passive referencequencher处均选择“none”

体系配制

组分 体积(μL)
C buffer 20

5

L buffer
P-core 12
E-core 0.6
dNTPs(10 mM) 1.5
下游引物(10 μM) 2
下游引物(10 μM) 2
探针(10 μM) 0.6
DNA模板 3.8
B buffer 2.5
总体积 50

 

 

 

N:阴性对照; P:正对照

注意事项:

  • 为保证液体试剂组分活性,请保证储存温度 ≤ -20 ºC;试剂使用时请保持低温,避免高温放置过长时间;
  • 在进行反应时请注意避免微量核酸染,并设置空白对照实验组。

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